清水潭堤段曾是里運(yùn)河大堤上著名的險(xiǎn)工患段。從高郵城北10公里處的馬棚灣到清水潭南端，長約3.3公里。明隆慶《高郵州志·卷二》云：“清水潭在州北二十里，故縣村新開湖旁，上有龍王廟。”據(jù)揚(yáng)州地區(qū)大運(yùn)河防震抗震指揮部1976年10月土質(zhì)資料匯編記載，這一段堤身就建在從高郵湖至射陽湖的一條古河槽上。古河槽寬約4公里，河床淤土深度最深達(dá)真高-27米左右，這條古河槽名叫石梁溪。明隆慶《高郵州志》云：“石梁溪，在州治西北，自天長縣發(fā)源入新開湖。”
公元前486年，吳王夫差為了北上伐齊，與晉國爭霸，在邗城城下開挖深溝，引長江水向北，經(jīng)武廣、陸陽兩湖之間，下注樊良湖（在今高郵西北20里），轉(zhuǎn)向東北入博支、射陽兩湖，又折向西，經(jīng)夾耶至末口入淮河。這條運(yùn)河因臨邗城，被后世稱為邗溝。邗溝從揚(yáng)州至樊良湖段的河道為新開河段，而樊良湖至射陽湖段的河道則是利用石梁溪舊有河道。所以造成河線迂曲，向東繞了一個(gè)大彎子。
由于海潮及風(fēng)力的推移作用，在東海上出現(xiàn)一個(gè)新沙洲，長約80公里，以產(chǎn)鹽著稱，漢時(shí)稱為鹽瀆。接著鹽瀆與長江北岸、淮河南岸沙嘴相接，將里下河淺水海灣封閉為瀉湖平原。平原上散布有大大小小的湖蕩沼澤。最大的射陽湖，至宋代時(shí)周圍仍達(dá)300里，是我國古代著名的五湖之一。石梁溪水受阻，不能再繼續(xù)流向大海，而只能流至射陽湖。后因高郵湖諸小湖水位抬高，漫過漕渠（唐時(shí)稱邗溝為漕渠），在漕渠至新湖邊線之間形成了一個(gè)新的湖泊，至宋初已被稱為“新開湖”。漕渠被淪入水下，漕船開始在湖中行舟。由于新開湖散漫多風(fēng)濤，為了減輕湖水對漕船的為害，宋天禧四年（1020年），江淮置制發(fā)運(yùn)副使張綸于高郵北沿湖筑堤200余里，稱為湖堤，并“錮巨石為十石達(dá)，以泄橫流。”由于有了湖堤的阻隔，石梁溪水受阻，不能再流向射陽湖，而只能流至新開湖。湖堤以東的石梁溪河段，被稱為清水潭。清水潭現(xiàn)長2600米，陸家溜以東已被淤漲為唐墩等蕩。唐墩等蕩表層以下即為淤土。此次建筑同（江）三（亞）高速公路遇到困難，后經(jīng)修改設(shè)計(jì)，采取加固措施，比原預(yù)算多開支了一千多萬元。
據(jù)《鹽城水利史話》記載，在射陽縣新坍鄉(xiāng)與建湖縣岡東鄉(xiāng)毗鄰的靠漁灣，也有個(gè)名叫“清水潭”的大塘，其潭深超過20米，水面約有30畝。1990年初，清水潭畔新塘村村民周正明，一心想抽干潭水看個(gè)究竟。他有一個(gè)親戚從臺灣回來探親。在他的資助下，周正明購回一噸柴油，租用七臺機(jī)泵，抽了五天五夜，潭水下降3米多。水位下降到5米時(shí)，潭水仍然是一篙子下去不能到底，而且潭四周出現(xiàn)多處塌方，位處十幾米外的供銷站屋墻也出現(xiàn)裂縫。在此情況下，周正明只好草草收場，以免釀成更大的損失。這個(gè)清水潭與高郵的清水潭是否有著某種關(guān)連，目前還不得而知，還有待于進(jìn)一步進(jìn)行考證。
金·明昌五年（1194年）黃河開始奪淮。由于黃淮水患經(jīng)常發(fā)生，使高郵湖諸小湖湖面不斷擴(kuò)大，這就給湖堤的安全造成了威脅。因?yàn)榍逅抖魏痰躺斫ㄔ谑合偻翆由希詷O易發(fā)生潰決。據(jù)《淮系年表》云，南宋·嘉泰三年（1203年），“十月，高郵大雨，決清水潭，郡守吳鑄堅(jiān)塞之。”這是清水潭堤段形成后有史料記載最早的一次決口，后為高郵軍郡守吳鑄所堵塞，并在清水潭建造了五龍祠（又叫五龍王廟）。
清代初年，當(dāng)時(shí)由于經(jīng)過40多年的戰(zhàn)亂，堤防失修，水患嚴(yán)重。從順治十五年（1658年）至康熙二十一年（1682年）蘇北淮河下游地區(qū)有25年連續(xù)發(fā)生洪水，里運(yùn)河先后在高郵清水潭決口8次（為康熙七年、八年、九年、十年、十一年、十二年、十五年、十九年），里下河地區(qū)洪水經(jīng)年不退，大批田地沉沒水底，雞犬之聲不聞?？滴蹙拍辏?670年）秋，年方30歲的蒲松齡應(yīng)同邑友人孫蕙邀請，到寶應(yīng)縣作幕賓，幫辦文牘。第二年三月，孫蕙調(diào)署高郵州，蒲松齡亦同往高郵。這一年汛期清水潭再次決口，蒲松齡曾兩次到清水潭決口處視察。他親眼目睹了“清潭決口波如山，云水萬頃相鉤連”的嚴(yán)重水災(zāi)以及老百姓因水災(zāi)“轉(zhuǎn)河壑而散四方”的悲慘處境，寫下了《清水潭決口》和《再過決口放歌》等詩篇。這些詩如實(shí)記錄了淮河水患給高郵人民帶來的苦難，發(fā)出了“精衛(wèi)銜石入滄海，徒竭民力糜金錢。河流地上杯盈溢，此塞彼決何時(shí)竣”的感嘆。
康熙十六年（1677年），清政府調(diào)任安徽巡撫靳輔代替王以新為河道總督，總理治河事宜。康熙十七年，靳輔奉旨堵塞清水潭決口，但是由于清水潭決口南北寬300余丈，水深七八尺，且與湖水相連，“湍波沖激”，很難施工。當(dāng)時(shí)南河分司蔡音達(dá)禮等估需57萬兩銀子還不敢保證必成。靳輔的幕僚、民間水利家陳潢察看了周圍地勢和水情，認(rèn)為只要10萬兩銀子就夠了。可是沒有人敢承擔(dān)這項(xiàng)工程，于是陳潢便決定親自負(fù)責(zé)施工。他拋開原來的決口向湖中另筑了兩道偃月形的土堤，東長605丈，西長921.5丈，首尾均與舊堤相連，這樣運(yùn)河就在高郵湖內(nèi)形成一個(gè)大彎道。至次年竣工，運(yùn)堤屹然鞏固，僅費(fèi)銀9萬兩。陳潢擔(dān)負(fù)的這項(xiàng)工程，不僅花錢少，而且質(zhì)量也很好，不再經(jīng)常潰決，從此漕船經(jīng)過這里一帆風(fēng)順，再也不會受漂溺之苦了，因而受到了康熙皇帝的嘉獎(jiǎng)，名新河為永安河。
同治五年（1866年）高郵湖河水勢盛漲，東堤岌岌可危，于六月二十七、二十八等日先后啟放車邏、南關(guān)等壩之后，水勢未見消落，東西岸皆漫塌過水。二十九日清水潭迤南二閘之墻被水沖卸，帶塌堤身，決口長186丈。里下河平地水深丈余，田廬被淹殆盡，人畜漂溺無數(shù)。高郵邑人談人格《清水潭決紀(jì)事》詩云：“準(zhǔn)擬今年秋，高廩與云齊。支祁（注）忽肆虐，一飽縱鯨鯢”“可憐千萬村，濁浪迷高低。富家得船去，余劫歸犬雞。貧者不及遷，淚沒如鳧鷗。”結(jié)果四名官員（其中道員、同知、千總、標(biāo)協(xié)各一人）以“疏于防范”的罪名被摘去頂戴或撤職，漕運(yùn)總督吳棠也被“交部議辦”?？偤訌堊尤f會同江督李鴻章相機(jī)堵塞，并奏派兩淮鹽運(yùn)司丁日昌就近督辦，揚(yáng)州候補(bǔ)知府程國熙副之，于當(dāng)年十一月初十日興工，經(jīng)一月余合龍。
新中國成立后，為了確保里運(yùn)河大堤防洪安全，1956年從高郵到界首筑了新東堤，將清水潭放入大運(yùn)河?xùn)|。據(jù)1980年7月7日邗江縣長江護(hù)岸工程指揮部測繪的高郵大運(yùn)河馬棚灣水下地形圖查得原清水潭位置已在現(xiàn)大運(yùn)河內(nèi)中心偏西，有大、小兩個(gè)深潭。大潭在南，潭口直徑約200米，小潭在大潭之北約600米，位處馬棚大灣南的直線河段開始處，潭口南北長約200米，東西寬約100米。在施工過程中曾發(fā)生滑坡，兩坡加筑了平臺，成為復(fù)式斷面，坡度加至1：15。由于地基淤土層較深，目前堤身仍在不斷沉陷。最大沉陷量已達(dá)0.9米。為了減輕荷載，堤頂上僅加做了漿砌塊石子堰。1976年抗震期間又采取了加固措施，加做了30至50米寬的平臺，從而進(jìn)一步鞏固了堤基。新中國成立后，雖有幾次大的洪水，但清水潭堤段都沒有發(fā)生潰決。
注：支祁，即傳說中的淮河水神支祁
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